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精選十個權威化合物信息數據庫

1、

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檢索可得到的結果包含了分子式、、2D和3D結構、InChI和、相對分子質量、脂水分配系數、氫鍵受體和供體數目、可旋轉鍵數目、互變異構體數目等基本的結構信息和物化性質,除此以外,還有該化合物作為藥物的劑型和商品信息、藥理性質、毒性、生物活性檢測等信息,并通過文獻分類副标題可以查看相關文獻。

數據庫于2004年正式對方開放使用,這是一個可以免費獲取使用的數據庫,其中包含了很多與有機小分子化學結構及其生物活性相關的信息。它包含了結構、命名和計算物理化學數據,并與NIH / 信息鍊接。

的數據信息被劃分成三個相互關聯的數據庫,即 、 和 ,這三個數據庫都隸屬于NCBI的信息檢索系統。

2、

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是一個隸屬于英國皇家化學會的彙總數據庫,包含了來自不同資源提供的五千五百多個化合物信息。現在,該數據庫含有的信息包括海洋天然産物數據、ACD實驗室化學數據庫、EPA的數據庫以及來自不同供應商的一系列化學物質信息。數據庫擁有多種搜索工具,而且大多數化合物都有計算物理化學性質值。

數據庫提供以下查詢方式:标準查詢方式包括系統名稱、商業名稱和同義詞、登記号查詢;高級查詢方式提供互動式搜索,通過化合物結構、化合物子結構,分子式以及分子量、CAS編号、供應商等進行高級搜索。還可以對搜索得到的結果進行進一進步的篩選以限定更小的搜尋範圍;還提供以iOS軟件應用(/iPod/iPad)為平台的移動設備搜索。同時也支持安卓系統。

3、-

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-是第一個專門為食品中多酚含量創建的綜合數據庫。數據庫中含有400種食物中500個不同多酚類物質的35,000多個含量值。這些數據信息是從1,300多篇科學文獻當中提及的60,000多種原始含量值中提取而來。在從論文提取數據之前,每一篇論文都經過了嚴格認真的審查和評估。用戶可以查詢經過各種分析方法鑒定得到的食品、多酚和代謝物。

4、ZINC

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包含2000多萬個化合物分子,适用于虛拟篩選。通過、格式等進行檢索,檢索結果中給出了化合物的結構,一些化合物的重要性質,包括xlogP,溶解度,氫鍵給體和受體數目等,以及二維和三維結構,供應商信息。用戶可以自行繪制或輸入分子的字符串來上傳待檢索的分子,同時,還可以限定淨電荷量、xLogP、可旋轉鍵數、氫鍵供體和受體數等參數範圍。庫中的分子結構均可被免費下載,支持、mol2、3DSDF和DOCK 格式,并且化合物的相關信息可以以表格形式下載,便于用戶使用。

5、

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該數據庫是一個獨特的生物信息學和化學信息資源相結合的藥物和藥物靶标數據庫。該數據庫包括8206個藥物條目,包括1991個FDA批準的小分子藥物,207個FDA批準的生物技術(蛋白/肽)的藥物,93個營養品和6000的實驗藥物。另外,4333個非冗餘蛋白質(即藥物靶标/酶/轉運體/)序列被鍊接到這些藥物條目上。

藥物信息包括了該藥物的CAS号、商品名、分子式、分子量、、2D和3D結構、logP、logS、pKa、熔點、吸收性、Caco-2細胞穿透性、藥物類别和臨床使用、性質描述、劑型與給藥途徑、半衰期、體内的生物轉化、毒性、作用于哪些生物體、食物對服用的影響、與其它藥物的相互作用、作用機理、代謝途徑、藥理學特征、與蛋白質的結合情況、溶解度、物質形态、同義詞、關于合成的相關文獻等,還與ChEBI、、等外部數據庫有鍊接。

6、

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是美國國家醫學圖書館(nlm)的化合物毒性相關數據庫,包括藥品毒理學、危險化學品和其它相關領域的信息,從可對下列子數據庫進行檢索:

HSDB (危險化合物數據庫):内含4500種毒性(或可能具有毒性的)化學藥品,以及其毒性、對環境的影響、化學安全性、廢棄物處置等相關領域的信息。

® :包括藥物和其它化學物質的生物化學、藥理學、生理學、毒理學的文獻數據庫。其中有300萬條引文、幾乎都有摘要和/或檢索條、以及CA登錄号。

:對NLM數據庫中的化學物質提供結構式和專業信息。

7、Drug

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RTECS主要包括以下六大類化學物質的毒性數據:直接刺激性( );緻突變性( );對生殖的影響( ,即緻畸性);緻腫瘤性( );急性毒性(Acute );其他多劑量毒性。

其中記錄有該化學物質的數值毒性值,如半數緻死量(LD50或LC50),最低中毒劑量(TDLo),最低中毒濃度(TCLo)等,以及實驗所使用的物種和給藥途徑。除此之外,所有的數據也都列出了其文獻來源,然而并沒有對其有任何的評估。

該數據庫中數據大部分都較為久遠,一些較新的化合物不被列入;此外,此數據庫查詢時會有一些bug,如需查詢一個化合物,最好通過不同方式如CAS号,通用名多次查詢,因為有些化合物可能通用名查不到,CAS号卻能查到。

8、 #

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首頁檢索(該數據庫檢索與Drug -化學物質毒性數據庫類似,需通過CAS号和化學名等多次檢索,有時候CAS号搜不出來,化學名可以,如下面CAS号搜索沒有結果,但是用化學名 就可以得到結果):提供化合物的安全技術說明書(MSDS),說明書中毒性一欄( )會提供化合物的一些毒性數據。

9、 Book

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是一家緻力于為化學行業用戶提供最有價值信息的資源平台,平台可以使用使用中文名稱,CAS号,英文名稱,分子式,分子量,MDL号,号,結構式等多種方式檢索,提供供化合物的安全技術說明書(MSDS),說明書中毒性一欄( )會提供化合物的一些毒性數據。

10、

最初是中科院内部使用的數據平台。其商用版網站摩貝網()于2013年9月上線,為一個化學品電商綜合服務平台。其中包含了化合物的百科信息,内容涵蓋了以上介紹的一至多個數據庫,如-化學物質毒性數據或MSDS。該平台的特點就是可以通過化學結構查詢化合物,因此可以搜索不知道CAS号的化合物,畫結構式的工具簡單上手。

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